阜阳卫生学校经安徽省人民政府批准，始创于1958年春。1998年以来，经阜阳市委、市政府批准，阜阳卫生学校先后与安徽省华佗中医学校、阜阳市卫生职业技术学校、阜阳市工读学校合并。教学资源重组后，办学层次和办学规模不断发展壮大。校园面积109482平方米，建筑面积75454平方米，校园环境优美，布局优雅，景致怡人。

为整合教育资源，促进中高等职业教育的协调发展，2013年市政府第29次常务会议研究决定：“阜阳卫生学校整体并入阜阳职业技术学院”。阜阳卫生学校整体并入后，仍在原校址办学，作为中专部，主要承担中职学历教育和卫生类五年制高职教育任务。 学校目前开设的三年制中职专业为护理、中医、助产、医学影像技术、康复技术、医学检验技术；五年制高职专业为护理、助产、医学影像技术和医学检验技术。阜阳卫生学校是“十三五”期间安徽省唯一经教育部和国家中医药管理局备案批准招生中等中医专业的学校。目前，在校全日制学生近5000人。 
学校始终把师资队伍建设作为头等大事来抓，目前已形成了以中青年为骨干的教师群体。师资力量雄厚，现有教职工140人，其中高级职称40人，中级职称47人，兼职教师58人。他们精通业务，教书育人，钟情教坛。近三年来，参与编写中、高职“十三五规划教材”35部，其中主编3人、副主编17人，发表科研论文44篇。
学校办学条件完善，教学设备先进、齐全。拥有教学楼、实验实训楼、学生公寓、图书馆、阶梯教室、多功能餐厅、浴室和设施齐全的运动场12000平方米。共有解剖、生理、病理、护理、中医等54个实验室；校外有34家二甲以上临床实习教学医院。

学校贯彻执行党的教育方针，落实立德树人的根本任务，全面推进素质教育，强化技能训练，为社会培养高素质的卫生技术人才。

2023年五年制大专招生专业